Jaunas koronu mutācijas ir bīstamas?

Vīrusi mutācijas dēļ pastāvīgi mainās, un jaunu variantu parādīšanās ir sagaidāms notikums, kas sākotnēji nerada bažas. Visā pasaulē ir novērota SARS-CoV-2 diversifikācija evolūcijas un adaptācijas procesu dēļ. Lielākajai daļai šo jauno mutāciju nav būtiskas ietekmes uz vīrusa izplatīšanos.

Tomēr dažas mutācijas var dot vīrusiem selektīvas priekšrocības, piemēram: B.

  • paaugstināta pārnesamība vai
  • spēja izvairīties no saimnieka imūnās atbildes

Šādos gadījumos šie varianti varētu palielināt risku cilvēku veselībai, tāpēc tos uzskata par satraucošiem variantiem (bažas variants, GOS). Pēc tam, kad Lielbritānijā bija vērojams straujš COVID-19 lietu pieaugums dienvidaustrumos, austrumos un Londonas apgabalā, bija lielas bažas, ka pastāv saikne ar jauno SARS-CoV-2 variantu, VOC 202012, kas iepriekš bija pazīstams kā “VUI - 202012/01 “varētu pastāvēt.

Sākotnējās analīzes parādīja, ka jaunais variants salīdzinājumā ar iepriekš cirkulējošajiem variantiem parādīja paaugstinātu pārnesamību, bet nepalielinājās infekcijas smagums. Tagad mutācija ir atklāta citās ES valstīs un visā pasaulē.

Par Corona variantu VOC 202012

Jauno variantu raksturo 23 mutācijas: ieskaitot vairākas smaile olbaltumvielu mutācijas. Tas ir neparasti liels mutāciju skaits vienā klasterī.
Trīm no šīm mutācijām ir potenciāls bioloģisks efekts un tās rada bažas:

  • N501Y mutāciju receptoru saistīšanas domēnā (RBD) raksturo spēcīgāka saistīšanās afinitāte pret cilvēka ACE2.
  • Divu aminoskābju 69-70del dzēšana var daļēji traucēt RT-PCR testēšanu, un tā ir notikusi arī vairākas reizes saistībā ar citām RBD mutācijām.
  • Mutācija P681H atrodas tieši blakus furīna šķelšanās vietai - zināmai vietai, kas pēc saistīšanās ietekmē vīrusa turpmāku iespiešanos šūnā.

Spike varianta N501Y iespējamās sekas

Pārnesamība

Ļoti iespējams, ka N501Y ietekmē smaile proteīna saistīšanās afinitāti ar receptoru, un ir iespējams, ka šī mutācija atsevišķi vai kombinācijā ar 69-70del delēciju N-terminālajā domēnā (NTD) palielina vīrusa pārnesamību. Tas pamatojas uz 501 atlikuma stāvokli smailes receptoru saistošajā domēnā un datiem, kas parāda, ka N501Y palielina tapas mijiedarbību ar cilvēka ACE2. Balstoties uz modelēšanu, pētnieki lēš, ka GOS 202012/01 ir par 56 procentiem infekciozāks [95% CrI: 0,37-0,75] nekā citi SARS-CoV-2 varianti.

Antigenitāte

501. pozīcija atrodas RBD, kur neitralizējošās antivielas darbojas visbiežāk, tāpēc var tikt ietekmēta vīrusa neitralizācijas efektivitāte. No vairākām dažādos pētījumos pārbaudītām monoklonālām antivielām viena (LYCoV016) parādīja samazinātu spēju neitralizēt SARS-CoV-2 variantus ar mutācijām 501. pozīcijā. Dabas infekcijas izraisīti poliklonālo serumu neitralizācijas dati par N501Y nav pieejami.

Ietekme uz diagnostikas testiem

GOS satur sešu nukleotīdu svītrošanu S gēnā, kas noved pie divu aminoskābju zuduma 69. un 70. pozīcijā (Δ69-70). Tā rezultātā komponents, kas nosaka S gēnu, PCR testos ir negatīvs, bet pārējie divi komponenti, kas meklē F un ORF1 gēnus, paliek pozitīvi. Pētnieki atklāja, ka> 99% sekvencēto S gēnu pamešanas (alēļu mazspēja, kas var novest pie tā, ka PCR primeri nesaistās un viena vai vairākas alēles netiek amplificētas vienā pieejā), bija Δ69-70. Tomēr, tā kā S gēns tika veiksmīgi pastiprināts, pētnieki secina, ka S gēna pamešanai ir jābūt qPCR zondes kļūmes dēļ Δ69-70 delēcijas rezultātā.

SARS-CoV-2 variants no Dienvidāfrikas

Papildus VOC 202012/01 Dienvidāfrika ir paziņojusi par vēl vienu SARS-CoV-2 variantu ar apzīmējumu 501.V2, kas arī ir svarīgs. Šis variants pirmo reizi tika novērots oktobrī. Kopš tā laika vairāk nekā 300 gadījumi ar 501. V2 variantu ir apstiprināti ar pilnīgu genoma sekvencēšanu Dienvidāfrikā, kur tas tagad ir dominējošais vīrusa variants.

Sākotnējie rezultāti norāda, ka šim variantam var būt arī paaugstināta pārnesamība. Tāpat kā ar GOS 202012/01, tomēr nav pierādījumu, ka 501.V2 ir saistīts ar lielāku infekcijas smagumu. 2020. gada 22. decembrī Lielbritānijā tika atklāti divi šī jaunā varianta 501.V2 ģeogrāfiski atsevišķi gadījumi. Abi gadījumi ir simptomātisku cilvēku kontakti, kuri bija atgriezušies no ceļojuma no Dienvidāfrikas. 2020. gada 28. decembrī Somijā tika atrasts vēl viens šī jaunā varianta gadījums, kurš atgriezās ceļotājā no Dienvidāfrikas

Ietekme uz vakcīnas efektivitāti?

Zinātnieki, piemēram, BioNTech izpilddirektors Ugurs Sahins un Oksfordas universitātes medicīnas profesors Džons Bels, ir teikuši, ka viņi pārbaudīs vakcīnas jaunajiem variantiem, un tie varētu veikt nepieciešamos uzlabojumus apmēram sešu nedēļu laikā. Tomēr šeit var būt nepieciešami papildu oficiāli apstiprinājumi.